近几年，基因检测这个词频频出现在大众的视野。对于非专业人士来说，基因是个多少带了几分神秘科技光环的词，检测此等神秘的存在，究竟有何神奇功用?基因检测对于血液病有何意义?带着这些问题，“MPN家园·大咖零距离”栏目，特别邀请浙江大学医学院附属第一医院金洁教授给大家解答。
Q：
基因是什么?
A：
每个人的生命特征都是由特定的“密码”编码蛋白并表达出来的，包括种族、血型、体格、发色、身高等体貌特征，甚至生、长、衰、病、老、死等一切生命现象，这些特征还可以遗传给后代。
这些储存着遗传信息的特殊“密码”，就是位于人体细胞当中的23对染色体上的碱基。他们排列组合，构成了携带着遗传讯息的DNA片段——基因，进而构成染色体。
如果某些“密码”出现错误，比如发生基因突变，则有可能导致某种疾病的发生。基因突变通常包括插入、缺失、重复、移码突变等。某些情况下，染色体的结构异常，导致两个不同的基因各自从中间断裂与对方相连而形成新的融合基因，它可能表达融合蛋白，导致某些疾病发生。
Q：
基因检测是什么?
A：
基因检测是通过血液、其他体液或细胞对DNA进行检测，找到那些可能致病的错误(突变)并解读的一项技术。它不仅可以诊断疾病，还可以用于预测疾病的风险，还是评估患者药物使用效果非常重要的一环。能从分子层面给医生用药以精确的指导，以便根据患者对药物的敏感程度，合理选择抗肿瘤药，制定精准的个性化方案。
Q：
基因检测有必要吗?
A：
对于血液系统恶性肿瘤疾病来说，基因检测是必须的。突变基因的检测在急性髓系白血病(AML)伴重现性遗传学异常、遗传易感性髓系肿瘤、骨髓增殖性肿瘤(MPN)、骨髓增生异常综合征伴环形铁粒幼红细胞(MDS-RS)、毛细胞白血病(HCL)和淋巴浆细胞淋巴瘤/华氏巨球蛋白血症(LPL/WM)的诊断中具有关键性的作用，对于其他血液肿瘤则起到辅助诊断的作用。对于初诊的血液病患者，症状大多只是血象的异常，并不能立刻明确是不是恶性疾病。此外，在多类疾病的早期阶段，鉴别诊断并非易事。因此，条件允许的话，初诊患者均可进行二代测序的检查，对于诊断及预后判断有积极的作用。
Q：
检测方法有哪些?
A：
基因检测包括基因测序、PCR(聚合酶联反应)、FISH(荧光原位杂交)等。
测序是直接把待测样本的序列读出来，测序技术分为一代测序和二代测序(NGS)。二代相比于一代，测序速度快，通量大，是目前发展最快的测序技术。而PCR、FISH等都是对一个已知的序列，判断待检样本是否存在相应序列的技术。
Q：
检测方法分优劣?
A：
各种技术间没有优劣之分，根据突变的种类及不同的临床情况选用适合的方法。PCR是点突变/小片段插入缺失的优先选用方法;FISH更适用于大片段插入缺失/拷贝数变异/融合(结构变异);而多基因多类型突变则建议做二代测序。
Q：
测出突变即患病吗?
A：
永远不能只根据测序的结果就直接诊断疾病，需要同时存在临床表现并结合其他化验检查综合判断。在有些疾病中，存在某种突变反而是预后良好的指标。
目前几乎所有二代测序报告单的测序结果都是分等级列表式呈现，通常会报出三类变异：强烈临床意义变异、可能临床意义变异以及意义未明变异。“意义未明变异”对于疾病的诊断及预后意义较小。前两类突变时，报告通常会写出其常出现的疾病种类及对预后的影响。如果患者其他临床特征及实验室检查均强烈指向这种疾病，则应重点关注。反之，则可暂不考虑突变的影响，但患者可能存在突变所相关疾病的易感性。
Q：
检测种类多就好吗?
A：
检测的基因种类并不是越多越好，根据疾病的类型，有需要重点检测的基因。
Q：
骨髓增殖性肿瘤(MPN)与哪些基因突变相关?
A：
一般所说的经典MPN，是特指三种疾病：真性红细胞增多症(PV)，原发性血小板增多症(ET)原发性骨髓纤维化(PMF)。目前JAK2、CALR、MPL为已经发现的三个驱动突变，均通过激活JAK-STAT通路致病。约90%的经典MPN可检测到其中之一，且这三个基因突变通常互斥，一位患者中通常只存在一种突变。
Q：
驱动突变是什么?
A：
肿瘤细胞的特点是不受控的增殖，使肿瘤细胞具有选择性生长优势的基因突变被称为“驱动”突变，也就是说驱动突变的存在使细胞成为了肿瘤。与之相对的为过客突变，其在细胞的增殖分裂中产生，但对肿瘤的发生发展没有直接作用，功能上偏中性。
Q：
哪种驱动突变在MPN疾病里最常见?
A：
JAK2突变可见于95%以上的PV和50-60%的ET和PMF。JAK2突变以JAK2 V617F(exon 14)突变最为常见，约占98%，见于PV、ET和PMF。JAK2 exon 12 突变约占1-2%，种类多样，错义、插入及缺失突变，目前已发现有17个不同的突变，以N542-E543del、K539L、E543-D544del最为常见。JAK2 exon12突变主要见于PV，极少见于ET和PMF。CALR突变可见于25%左右的ET和35%左右的PMF，在PV中罕见。CALR突变也见于MDS(8%)、RARS-T、CML，偶见于正常人。CALR突变主要为exon9 的插入/缺失突变，目前已经发现有36种突变。分为1型(52bp的缺失)和2型(5bp的插入)，分别占53.0%和31. 7%，均可导致读码框架位移。1型更多见于PMF。MPL突变主要在ET和PMF中出现，在PV中基本没有。其概率为：ET约 3-4%，PMF约 8-10%。MPL的突变主要为：exon 10上的W515L 或 W515K突变，很少出现 W515A、 S505N突变。
Q：
哪种突变提示预后良好?
A：
对于PMF，目前认为CALR基因突变为预后良好的生物学标志。CALR基因突变PMF患者的死亡率低于JAK2 V617F突变患者。MPL基因突变较JAK2及CALR相比较少见。有研究进一步分析了1型及2型CALR基因突变对PMF预后的影响，发现2型CALR基因突变与DIPSS-plus评分为高危以及外周更多的原始细胞相关，而1型CALR基因突变患者生存期要长于JAK2 V617F突变和2型CALR基因突变患者，提示1型CALR基因突变为PMF预后良好的指标。
Q：
三阴性MPN如何理解?
A：
虽然在约90%的MPN(特指PV、ET和PMF)中可检出JAK2、CALR、MPL基因突变，但仍有约10%的MPN无法检出这三种基因的突变，称为三阴性MPN。对这部分肿瘤的分子特征的研究也在不断进行，目前已经发现可能相关的突变有：
①不典型突变 前文所述，JAK2、CALR、MPL的突变高度集中在几个常见位点，故常规检测主要检测这些常规位点，在三阴性MPN中，部分可检出三种基因的非常见位点突变，如MPL的S505N、W515R、JAK2的V625F、G571S、F556V等突变。
②信号通路相关 JAK2-STAT信号通路相关基因突变，如LNK基因，编码JAK2抑制因子，其失活突变可引起JAK2信号通路激活。
③其他基因突变与修饰 此外，非JAK2-STAT信号相关的基因突变以及相关修饰，如甲基化等，可能也有一定的价值。如TET2、ASXL1、CBL、IDH、IKZF1等。
“基因是生命的密码”，基因检测对血液疾病尤其是MPN等血液系统恶性肿瘤疾病意义重大。希望我们本期分享能帮你正确认识“基因检测”，助您在未来的诊断、治疗上，少走弯路，顺利回归正常生活!
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